Mimo korzyści, jakie niesie ze sobą bieganie w ciąży, istnieją sytuacje, w których należy go unikać. Bezwzględne przeciwwskazania to m.in. ciąża zagrożona, krwawienia, problemy z łożyskiem, wcześniejsze poronienia czy skurcze macicy. W przypadku nadciśnienia, cukrzycy ciążowej lub silnych bólów kręgosłupa warto skonsultować się z lekarzem.